R 语言作图时，默认情况下软件会按照自己的方式对坐标轴的项目进行排序，然而这种排序往往不是我们所希望的，因此需要想办法让坐标轴的项目按照我们希望的顺序输出。
如下所示，我有两列数据，要绘制箱线图，以第一列为 Y 轴，第二列为 X 轴，希望 X 轴的输出顺序按照第二列由上到下排列。
size type | |
6.612309456 T-8 | |
5.878857613 T-10 | |
6.724282265 T-15 | |
5.68136692 T-56 | |
5.863334656 T-1723 |
然而软件输出的顺序如下：
T-10 T-15 T-1723 T-56 T-8 |
解决方案：
通过一个因子事先自定义 X 轴顺序，作图命令如下：
#读入数据 | |
gsize <- read.delim("gsize.txt", header=TRUE, sep="\t", stringsAsFactors=FALSE) | |
#自定义 X 轴顺序 | |
x1 = factor(gsize$type, levels=c("T-8","T-10","T-15","T-56","T-1723")) | |
#用 x1 代替 gsize$type 绘图 | |
boxplot(size~x1, data=gsize, xlab="Sequence Type", ylab="Genome Size", varwidth=TRUE, notch=FALSE) |
至此，X 轴各项目会按照我们自定义的顺序排列。
